Question
अनुक्रम विश्लेषण में PAM और BLOSUM जैसे अमीनो अम्ल प्रतिस्थापन मैट्रिक्स की संरचना और महत्व की व्याख्या कीजिए।
Answer :
Word Count : 479
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जैवसूचना विज्ञान में अनुक्रम विश्लेषण का प्रमुख उद्देश्य विभिन्न जैविक अनुक्रमों, विशेषकर प्रोटीन अनुक्रमों, के बीच समानता और विकासात्मक संबंधों की पहचान करना है। प्रोटीन अनुक्रमों की तुलना करते समय यह समझना आवश्यक होता है कि एक अमीनो अम्ल के स्थान पर दूसरा अमीनो अम्ल कितनी संभावना से आ सकता है और ऐसा परिवर्तन जैविक रूप से कितना स्वीकार्य है। इसी आवश्यकता को पूरा करने के लिए अमीनो अम्ल प्रतिस्थापन मैट्रिक्स का उपयोग किया जाता है, जिनमें PAM और BLOSUM मैट्रिक्स सबसे अधिक प्रचलित हैं। PAM (Point Accepted Mutation) मैट्रिक्स का निर्माण मार्गरेट डेहॉफ द्वारा किया गया था। इसकी संरचना निकट संबंधी प्रोटीन अनुक्रमों के अध्ययन पर आधारित है, जिनमें बहुत कम विकासात्मक परिवर्तन हुए होते हैं। PAM मैट्रिक्स में प्रत्येक मान यह दर्शाता है कि किसी निश्चित विकासात्मक दूरी पर एक अमीनो अम्ल के दूसरे में परिवर्तित होने की संभावना कितनी है। PAM1 मैट्रिक्स 1% स्वीकृत उत्परिवर्तन को दर्शाता है, जबकि PAM250 जैसे उच्च क्रम के मैट्रिक्स अधिक विकासात्मक दूरी वाले अनुक्रमों के लिए उपयोगी होते हैं। इन मैट्रिक्स की संरचना गणितीय मॉडलिंग पर आधारित होती है, जहाँ अवलोकित उत्परिवर्तनों से
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